用數位相機不好嗎？跟顯微鏡專用相機有什麼區別？
相信很多人有拿著相機對著目鏡拍的經驗，小編也不例外。可是常常對不到焦、呈相圈明顯，或是晃動嚴重。拍照時也不好確定視野下的到底拍到的是什麼。數位相機不是不好，只是不適合。數位相機本身有鏡頭，和內建為日常攝影設定做最佳化的感光元件與軟體設置。在顯微鏡上這些設置反而是種干擾。顯微鏡專用相機不會有額外鏡片造成耗損，不會有呈像圈，更不會晃動，給您清晰的影像。
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單色還是彩色？
單純的感光元件只能感應光的強弱，並不能分辨色彩。彩色相機之所以是彩色，是因為有在感光元件前有RGB分色的塗層，讓感光元件上面的畫素感知道不同顏色光的強弱，最後再把不同顏色的強度資訊整合在一起，創造出我們熟知的彩色影像；單色感光元件就沒有分色塗層，能夠感知道所有波長光線的強弱。因為沒有塗層，感光元件的靈敏度也會較彩色感光元件來的好。在專業影像分析領域中，我們可以使用濾光片或是不同染劑，選擇我們需要的波長。像是螢光影像的擷取的場合，單色相機的表現會比彩色相機要來的好。
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CCD還是CMOS？
CCD是比較成熟的電子感光元件，有低雜訊高感光度的優點，不過製程較複雜，價格也比較貴；CMOS相較於CCD是較便宜的電子感光元件，早期在呈色與感光度上皆不如CCD的表現，不過可以滿足明視野攝影的需求。若僅有明視野影像擷取的需求，CMOS相機即可以使用。
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畫素越高越好？
『畫素越高，影像系統的等級越好』。這應該是一般人的認知，基本上也不是錯誤啦，只是沒有100%是對的。在明視野下面基本畫素越高畫質也會越好，可是在低光源下面就不一定是這樣。感光度與每個畫素的大小也有關係。把進光量當作雨滴，畫素大小當作水杯，在一定時間內可以接到的水量，畫素大小越大，可以接到的光量也越多，感光度也越好。君不見高階的螢光型相機其畫素都不會很高，反而是明視野用的顯微鏡相機的畫素都比一般的CCD相機來的高上許多。
有人會說，畫素越高，可以得到的細節也越多。基本上是對的，前題是鏡頭素質很好。就常見的高清Full HD 格式，也只不過200萬畫素，300萬畫素即可輸出4×6 inch的相紙。太多的畫素，大多用不到。
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冷卻CCD？-20℃？-45℃？
雜訊一直是電子感光元件的缺點。雜訊的來源很多，其中最大的來源是『溫度』。把溫度降低可以大幅降低雜訊。這種雜訊在平常攝影是看不到的。可是在螢光攝影時，曝光時間長，背景又多半是黑的，此時『雜訊』就很明顯。做定量實驗時，雜訊很容易影響到數值。此外，冷卻效果越好，可以曝光的時間也越長，曝光越長訊號也會越強。
顯微鏡影像感測器一些比較細部的規格，舉例說明如下：
- 圖元大小（Pixel Size）
指個別感應圖元的實際尺寸大小，不論是長或寬，都以μm（Micrometer）為計量單位。圖元愈大，則所需曝光成像時間較短，但卻會犧牲些許空間解析度。反之，圖元愈小，則需較久的曝光成像時間，成像之後的的解析度較好。
- 暗電流（Dark Noise Current）
在某特定工作溫度的條件下，遮蔽CCD的感應器，使其避免任何光源的照射或感光，而經由感測元件本身產生的電荷數（Electrons）。雜訊值的大小，以特定溫度，每秒產生的電荷數為主要單位
- 輸出雜訊（ReadOut Noise）
CCD正常工作時，除了真正有效的輸出訊號外，因其因素造成而隨之輸出電荷數所造成的雜訊。
- 量子效應（Quantum Efficiency）
直接進入或投射在感測組件上光子總數（Photons），與被感測器換成電荷數的比率。通常用百分比(%)來表示。
- 電位井容量（Fall-well Capacity）
每個圖素所有容納的電荷總數量。數目愈多，影像的動態範圍（Dynamic Range）愈大；更能表現影像上，任何微小明暗度的變化。
- 模擬數位化（analog to digital）
是CCD攝影機輸出影像訊號的格式，早期所制定的標準型CCD，多採用模擬類比的訊號輸出。現今數位化的趨勢，廠商在CCD內建類比轉數位(ADC)電路把類比訊號轉成數位訊號。攝影機能提供影像的灰階度取決於A/D轉換電路的位元數。例如8位元攝影機可以提供28＝256灰階輸出；10位元的攝影機可以提供1024灰階度表現。
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