彗星分析方法,可直接觀察單一細胞DNA損傷的程度。是一種快速、 簡易性、及高靈敏度檢測各別細胞DNA受損的方法(Singh et al., 1988) 應用電泳設備,即可進行分析



彗星分析方法,可直接觀察單一細胞DNA損傷的程度。是一種快速、 簡易性、及高靈敏度檢測各別細胞DNA受損的方法(Singh et al., 1988) 應用電泳設備,即可進行分析


<原理>


單細胞凝膠電泳(Single Cell Gel Electrophoresis Assay)是一種快速、 簡易性、及高靈敏度檢測各別細胞DNA受損的方法(Singh et al., 1988)結合傳統生物化學的技術,並利用細胞在膠體電泳的分析下,偵測DNA單股斷裂﹔斷裂之DNA會移出細胞外,形成拖尾的現象﹔若細胞DNA未損害則移動慢且會留在核質體內


 


<廣泛應用>


環境毒理中對DNA損壞作用的分析﹔


1. 如紫外光、電離輻射、氧自由基等因素造成的DNA受損


2. 細胞凋亡


3. 抗癌藥物的藥物毒理學研究


4. 遺傳毒理學研究(取代傳統UDS分析)


5. 腫瘤治療的跟蹤監測


 


<特點>


1. 統計分析


2. 每個檢體只要<10,000即可做分析


3. 偵測DNA受損的靈敏度高


4. 適用各種試驗的細胞


 


細胞處理:


      彗星分析法是設計用來評估單一個細胞DNA受損的情形,所以只要是細胞皆可做彗星分析試驗樣品須使用新鮮樣品,且須在4℃ 下製備,以避免細胞大量死亡每片CometSlide最佳細胞數為500~1000(75ul),是觀察彗星影像的最佳條件


 


細胞來源:


 溶於無Ca++Mg++PBS懸浮細胞: 1 x 105 c ells/ml於預冷的1xPBSmedium會干擾agarose的附著能力


貼附型細胞:刮取1 x 105 c ells/ml於預冷的1xPBS


組織細胞: 剪碎細胞取1 x 105 c ells/ml於預冷的1xPBS


 


對照組細胞準備:


      100 uM hydrogen peroxide     20/ 4℃


      25 uM KMnO4                 20/ 4℃


 


注意事項


(1)必須避光避免UV所造成DNA受損


(2)PBS(Ca Mg free)先預冷至4C,以抑制細胞在準備過程中內源性酵素的損害或抑制repair反應


(3)每片CometSlide最佳細胞數為500~1000個,是觀察彗星影像的最佳條件


50ul 1x105/ml Cells  500ul LMAgrose  è~700 Cells/75ul 5000 Cells  


 


                                                    


分離膠的製作


彗星分析法是設計用來評估單一個細胞DNA受損的情形,所以細胞間必須能分開,才能進行評估(傳統方法製作分離膠要平穩,以避免DNA位於不同水平面而產生模糊的彗星影響)< span>提供獨特的CometSlide可快速分析DNA受損>


CometSlideTrevigen的熱門商品


表面具有獨特的Teflon設計提供客戶直接將細胞/低熔點agarose加入CometSlideCometSlide節省實驗的時間可排除因繁瑣步驟所造成實驗變異


 


浸泡溶解緩衝液


目的在去除細胞膜及核膜極大部份的蛋白質,同時將DNA雙股斷裂展開形成單股斷裂,以增加分析的敏感性(傳統方法溶解緩衝液的濃度、酸鹼值及浸泡時間等因素會影響細胞的溶解程度)< span>提供最佳化的Alkaline Lysis可提高分析靈敏度>(浸泡溶解緩衝液,可將殘留部份的鹽類中和,因為殘留在DNA的部份鹽類,會中和DNA的磷酸根,進而抑制DNA的電泳情形


電泳DNA單股斷裂,可因為電泳槽中電極的驅使而自DNA團塊中被拖引出來,經由適當的染劑染色後,在螢光顯微鏡下可以看見很像彗星的影像


< span>提供SYBR green染色或銀染 將彗星影像最佳化呈現>


可選擇電泳方式: 1xTBE Buffer or alkaline electrophoresis solution (二擇一) Alkaline electrophoresis : 靈敏度高且可偵測微量的DNA損傷(單股DNA斷裂、雙股DNA斷裂、AP-site缺失(gamma irradiation) 電泳設定為低安培下電泳延長為40


 


影像分析與計算


 


隨機選取至少75個彗星影像,於螢光顯微鏡下觀察並照相,並計算尾部長度百分比( of tail lenghth)、尾部亮度百分比 ( of tail lenghth)、尾部動量


 (tail moment)等參數


 


尾部DNA長度 (tail lenghth, TL) = 彗星影像全長-頭部區域長度


尾部區域長度百分比( of tail lenghth, %TL)= ( 尾部DNA長度/彗星影像全長 ) x100


尾部亮度百分比 ( of tail intensity, %TI) = [(彗星影像總亮度和-頭部區域亮度)/彗星影像總亮度和]x100尾部動量 (tail moment, TM) =尾部長度百分比x 尾部亮度百分比


 


 


原廠連結: http://www.trevigen.com/


更多參考內容: WWW.BIOPIONEER.COM.TW


太鼎生物科技有限公司(02)86609496


 


 


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