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亞硝酸鹽檢測試劑盒 (Griess Reagent) | 貨號k544-200  (abcam ab234044) 

亞硝酸鹽（Nitrite; NO2 - ）累積量測定套組-Griess Reagent

在幾乎每個生物體中都發現了Nitrogen-based ions氮基離子，Nitrogen-based ions亞硝酸鹽和nitrate硝酸鹽。此外，在哺乳動物中發現內源亞硝酸鹽水平，也可從dietary sources膳食來源獲得。在人類中，nitrit亞硝酸鹽 (nitrite) 進一步代謝為一氧化氮(Nitric Oxide)和其他活性氮物質（reactive nitrogen species, nitrogen oxides氮氧化物）。硝酸鹽 - 亞硝酸鹽 -  NO生化途徑因其參與細胞信號傳導(cell signaling)，缺氧依賴性反應(hypoxia-dependent response )和血流調節而眾所周知。最近的研究表明線粒體中亞硝酸鹽還原為氮氧(Nitrogen Oxygen )。具體而言，肌紅蛋白(myoglobin)和黃嘌呤氧化還原酶(xanthine oxidoreductase)可在低氧條件下產生NO，從而導致線粒體呼吸。BioVision的亞硝酸鹽檢測試劑盒使用Griess Reagent，這是一種用於估算亞硝酸鹽的常用測量方式。在該測定中，使用Griess試劑I將亞硝酸鹽還原為氮氧化物。然後，氮氧化物與Griess Reagent II反應形成穩定的產物，其可通過其在OD 540nm處的吸光度來檢測。一個步驟快速簡單分析，檢測低至1 nmol /孔的亞硝酸鹽水平。

ELISA儀器設備請按此  (標配405、450、492、630 nm濾片/最高可擴充至7濾片）（k544 λ= 540 nm）

Inorganic Ions無機離子或電解質是對細胞生物的正常功能至關重要的組分，並且有助於支持許多活動，包括骨骼/牙齒的形成，神經元活動，肌肉收縮等。BioVision擁有多種測量方法，用於測量多種無機離子，包括鈣，鐵，鎂，鋅，磷酸鹽等。 該測定使得能夠從各種樣品，測量這些分子之含量。

鈣呈色測定試劑盒 | 貨號K380 Calcium Colorimetric Assay Kit  (abcam ab102505)

Calcium 鈣是所有生物體中必不可少的，Ca2 +螯合和釋放出細胞質作為許多細胞過程的信號。在 bones骨骼和teeth 牙齒中發現99％的鈣，其餘1％存在於blood 血液和 soft tissue軟組織中。Serum calcium 血清鈣水平受到嚴格控制（8.4-11.4 mg / dL），超出該範圍的任何變化都會產生嚴重影響。鈣在調節血管的 constriction 收縮和relaxation 鬆弛，nerve impulse transmission神經衝動傳遞， muscle contraction肌肉收縮和激素分泌方面發揮作用。鈣離子通道控制鈣離子跨越細胞膜的遷移，允許多種酶的活化和抑制。低鈣水平的原因包括chronic kidney failure慢性腎功能衰竭， vitamin D deficiency維生素D缺乏症，以及嚴重酒精中毒可能發生的低血鎂水平。BioVision的鈣測定試劑盒利用在calcium ions鈣離子和 0-cresolphthalein O-甲酚酞之間形成的chromogenic complex顯色複合物，於575nm測量吸收（λ= 575nm），在鈣濃度0.4-100mg / dL（0.1-25mM）的生理學重要範圍內提供簡單的測定方法。

肝素是唯一不會干擾的抗凝血劑。樣品製備：血清或尿液樣品可直接用於該測定。 放置10μl樣品在96孔板中的孔中。 對於其他液體樣品，添加2-50μl樣品
個人好。 用dH2O使總體積達到50μl。 可以測定樣品沒有任何事先處理。 一些MRI造影劑可能會導致瞬態干擾化驗

 α-Galactosylceramide | α-Tocopheryl succinate | Wogonin | VK3-OCH3 | Vinorelbine Tartrate

  鈣呈色測定 | Magnesium鎂呈色測定 |磷酸鹽比色測定 | 鈉呈色分析 | Zinc鋅呈色測定  

雷帕黴菌（Rapamycin）| Romidepsin (FK228, depsipeptide) | Daptomycin | G-418 (80 S 核醣體延伸抑制劑) 

Tubastatin A | CAS#1252003-15-8 APExBIO  貨號A4101

HDAC6 inhibitor,potent and selective

組蛋白去乙醯化酶 (Histone deacetylases , HDACs) 和組蛋白乙醯轉移酶 (histone acetyltransferases , HATs) 介導組蛋白去乙醯化(histone deacetylation)和乙醯化(acetylation)之間的平衡。 HDAC 還調節信號分子(signaling molecules)、伴侶蛋白(chaperones)和非組蛋白(non-histone proteins)轉錄因數的乙醯化狀態 [2]。 HDAC6 與分子伴侶 HSP90 相互作用。 HDAC6 對 HSP90 的去乙醯化對穩定性和許多客戶蛋白（包括 Bcr-Abl、c-Raf 和 A​​KT）的穩定性很重要。因此，HDAC抑制劑具有抗癌作用(anti-cancer function )[2]。

 與其他 HDAC 相比，Tubastatin A 是 HDAC6 的選擇性抑制劑(selective inhibitor)。 Tubastatin A 的選擇性比 I 類 HDAC 平均高 200 倍。 Tubastatin A 對除 HDAC8 以外的所有同種型均表現出選擇性

超過1000倍。 Tubastatin A 以劑量依賴性方式(dose-dependent manner)保護免受 HCA 誘導的神經元細胞死亡(neuronal cell death)。 Tubastatin A 在 2.5 μM [1] 時誘導 -tubulin 的高乙醯化。在 LPS 刺激的人類 THP-1 巨噬細胞中，Tubastatin A 顯示出對 IL-6 和 TNF 的顯著抑制作用，IC50 為 712 nM 和 212 nM [3]。 Tubastatin A 在小鼠 Raw 264.7 巨噬細胞中顯示出抑制一氧化氮 (NO) 分泌的作用，IC50 為 4.2μM [3]。 Tubastatin-A 還在 KMCH 細胞中顯著抑制 10μM 的細胞增殖 [4]。

1. Xuan Li, Hexige Saiyin, et al."HDAC6 is critical for ketamine-induced impairment of dendritic and spine growth in GABAergic projection neurons." Acta Pharmacologica Sinica (2020). PMID:32939037

2. Huang Y, Yang W, et al."Droxinostat sensitizes human colon cancer cells to apoptotic cell death via induction of oxidative stress." Cell Mol Biol Lett. 2018 Jul 28;23:34. PMID:30065760

3. Topper MJ, Vaz M, et al. "Epigenetic Therapy Ties MYC Depletion to Reversing Immune Evasion and Treating Lung Cancer." Cell. 2017 Nov 30;171(6):1284-1300.e21. PMID:29195073

4. Carolina dos S. Passos, Nathalie Deschamps,et al. "Methods for addressing the protein-protein interaction between histone deacetylase 6 and ubiquitin." biorxiv.2017 October 15.

5. Adeegbe DO, Liu Y, et al. "Synergistic Immunostimulatory Effects and Therapeutic Benefit of Combined Histone Deacetylase and Bromodomain Inhibition in Non-Small Cell Lung Cancer." Cancer Discov. 2017 Aug;7(8):852-867. PMID:28408401

6. Bagnall NH, Hines BM, et al."Insecticidal activities of histone deacetylase inhibitors against a dipteran parasite of sheep, Lucilia cuprina." Int J Parasitol Drugs Drug Resist. 2017 Apr;7(1):51-60. PMID:28110187

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雷帕黴菌（Rapamycin）| Romidepsin (FK228, depsipeptide) | Daptomycin | G-418 (80 S 核醣體延伸抑制劑) 

(S)-Crizotinib | CAS#877399-52-5;1374356-45-2 APExBIO  貨號A8802

Potent MTH1 inhibitor

http://biopioneer.com.tw/wp-content/uploads/downloads/2022/10/Oxaliplatin-CAS61825-94-3-APExBIO-貨號A8648.pdf

(S)-crizotinib 選擇性抑制 MTH1 催化活性，IC50 為 72 nM，而臨床使用的 (R)-對映異構體無活性，IC50 為 1375 nM。此外，與 (R)-對映異構體相比，直接結合測定 (ITC) 表明 (S)-對映異構體對 MTH1 的親和力高 16 倍。通過使用 Km 濃度的底物，(S)-crizotinib 和 MTH1 底物 8-oxo-dGTP 和 2-OH-dATP 的平均 IC50 值分別為 330 nM 和 408 nM。 (S)-crizotinib 有效抑制 SW480 細胞和 KRAS 突變的 PANC1 細胞的集落形成，類似於 SCH51344。此外，體外 Kd 測量表明，(S)-克唑替尼對既定靶標 ALK、MET 和 ROS1 的效力遠低於 (R)-對映異構體。 (S)-crizotinib 未檢測到對 SW480 細胞增殖的任何顯著影響，並且對 SV40T 和 KRASV12 細胞具有最高的毒性。 (S)-crizotinib 與 (R)-crizotinib 相比，有效地穩定了 MTH1，使用細胞熱位移測定驗證了 BJ-KRASV12 細胞內的差異靶向。 (S)-crizotinib 誘導 DNA 單鏈斷裂增加，激活人結腸癌細胞(human colon carcinoma cells)中的 DNA 修復(DNA repair)，並有效抑制動物模型中的腫瘤生長(tumour growth)，這是通過 MTH1 抑制破壞核苷酸池穩態(nucleotide pool homeostasis)的結果。

體內小鼠異種移植研究表明，(S)-克唑替尼，而不是 (R)-對映異構體，能夠損害整體腫瘤進展，並特別減少腫瘤體積超過 50%。

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Oxaliplatin | CAS#61825-94-3 APExBIO  貨號A8648

Antitumor agent.

Oxaliplatin主要通過符合 DNA 加合物來抑制 DNA 合成。Oxaliplatin是一種鉑化合物(platinum compounds)，具有廣譜的抗腫瘤活性(anti-tumor activity)，並且已證明與其他鉑化合物(platinum compounds)缺乏交叉耐藥性。Oxaliplatin誘導導致細胞凋亡(cell apoptosis)的原發性和繼發性 DNA 損傷。

體外：Oxaliplatin對人黑色素瘤細胞系(melanoma cell lines) C32 和 G361 具有活性，IC50 值分別為 0.98 mM 和 0.14 mM。Oxaliplatin有效抑制膀胱癌細胞系(bladder carcinoma cell lines) RT4 和 TCCSUP、卵巢癌細胞系 (ovarian carcinoma cell line )A2780、結腸癌細胞系 HT-29(colon carcinoma cell line)、膠質母細胞瘤細胞系(glioblastoma cell lines) U-87MG 和 U-373MG，以及黑色素瘤細胞系(melanoma cell lines) SK-MEL-2 和 HT-144 IC50 值分別為 11 μM、15 μM、0.17 μM、0.97 μM、17.6 μM、2.95 μM、30.9 μM 和 7.85 μM。

臨床試驗：在轉移性結直腸癌患者中，與氟尿嘧啶/亞葉酸聯用，Oxaliplatin作為一線治療和對先前化療無效的患者均顯示出對轉移性結直腸癌的活性。此外，Oxaliplatin在鉑類預處理的卵巢癌、非霍奇金淋巴瘤、乳腺癌、間皮瘤和非小細胞肺癌患者中也顯示出療效。

1. Qing Zhang, Yue Zhou, et al. "Low-dose orlistat promotes the therapeutic effect of oxaliplatin in colorectal cancer." Biomed Pharmacother. 2022 Sep;153:113426. PMID: 36017794

2. Xia Liao, Yaoyao Zhang, et al. "Inositol hexaphosphate sensitizes hepatocellular carcinoma to oxaliplatin relating inhibition of CCN2-LRP6-β-catenin-ABCG1 signaling pathway." J Cancer. 2021 Aug 24;12(20):6071-6080. PMID: 34539880

3. Liao X, Song G, et al. "Oxaliplatin resistance is enhanced by saracatinib via upregulation Wnt-ABCG1 signaling in hepatocellular carcinoma." BMC Cancer. 2020;20(1):31. PMID: 31931755

4. Feng M, Jin JQ, et al. "Pharmacological inhibition of β-catenin/BCL9 interaction overcomes resistance to immune checkpoint blockades by modulating T(reg) cells." Sci Adv. 2019 May 8;5(5):eaau5240. PMID: 31086813

5. Cho SY, Chae J, et al. "Unstable Genome and Transcriptome Dynamics during Tumor Metastasis Contribute to Therapeutic Heterogeneity in Colorectal Cancers." Clin Cancer Res. 2019 Jan 22. PMID: 30670495

6. Goodspeed A, Jean A, et al. "A Whole-genome CRISPR Screen Identifies a Role of MSH2 in Cisplatin-mediated Cell Death in Muscle-invasive Bladder Cancer." Eur Urol. 2019 Feb;75(2):242-250. PMID: 30414698

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RGFP966 | CAS#1357389-11-7;1396841-57-8 APExBIO  貨號A8803

Specific HDAC3 inhibitor.

RGFP966 is a selective inhibitor of HDAC3 with IC50 value of 80 nM [1].

RGFP966 是 HDAC3 的選擇性抑制劑，IC50 值為 80 nM [1]。HDAC3（histone deacetylase 3, 組蛋白脫乙醯酶 3）是 HDACs 家族的一種異構體，在 DNA 轉錄調控(DNA transcriptional regulation)中起重要作用。已經表明，HDACs 涉及多種生物過程，如 DNA 修復(DNA repair)、複製(replication)、轉錄(transcription)和染色質結構(chromatin structure)。許多研究表明，HDACs 是大腦中表達最高的 I 類 HDAC，負向參與學習(learning)和記憶過程(memory process) [2]。

RGFP966 是一種有效的 HDAC3 抑制劑(HDAC3 inhibitor)，在濃度高達 15 μM 時對其他 HDAC 沒有抑制作用。使用底物依賴性生化試驗研究RGFP966對HDACs的抑制作用，結果表明它抑制HDAC3的IC50值為80 nM，而對其他HDACs沒有有效抑制作用[1]。當用 RGFP966 對皮膚 T 細胞淋巴瘤 (T cell lymphoma , CTCL) 細胞系進行測試時，通過抑制增加細胞凋亡的 HDAC3，細胞生長(cell apoptosis)顯著降低 [3]。

在雄性 C57BL/6J 小鼠模型中，在給予 RGFP966 後在亞閾值期間對它們進行物體識別 (ORM) 和位置依賴性物體識別 (OLM) 訓練，顯著增加了新的物體偏好並增強了長期 OLM 的劑量-依賴方式[1]。

1. Zhang M, Urabe G, et al. "HDAC6 Regulates the MRTF-A/SRF Axis and Vascular Smooth Muscle Cell Plasticity." JACC Basic Transl Sci. 2018 Dec 31;3(6):782-795. PMID:30623138

2. Huang L, Lai WH, et al. "Elimination of HIV-1 Latently Infected Cells by Gnidimacrin and a Selective HDAC Inhibitor." ACS Med Chem Lett. 2018 Feb 6;9(3):268-273. PMID:29541372

3. Topper MJ, Vaz M, et al. "Epigenetic Therapy Ties MYC Depletion to Reversing Immune Evasion and Treating Lung Cancer." Cell. 2017 Nov 30;171(6):1284-1300.e21. PMID:29195073

4. Sun XY, Qu Y, et al. "Novel histone deacetylase inhibitor N25 exerts anti-tumor effects and induces autophagy in human glioma cells by inhibiting HDAC3."Oncotarget. 2017 Sep 8;8(43):75232-75242. PMID:29088860

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AZD6738 | CAS#1352226-88-0 APExBIO  貨號B6007

ATR inhibitor

AZD6738 是一種選擇性 ATR（Ataxia Telangiectasia and RAD3-related, 共濟失調毛細血管擴張症和 RAD3 相關）抑制劑，對resting CLL 細胞的 IC50 約為 30 uM [1] [2]。ATR 是一種 PI3K 相關激酶。它參與DNA損傷的修復(repair)。在細胞分裂(cell division)過程中，它在單鏈 DNA 斷裂位(single strand DNA breaks)點被募集(recruited)和激活(activated)，以幫助啟動 DNA 修復(DNA repair) [1]。

γH2AX 作為 DNA 損傷(DNA damage)的生物標誌物。在一個能夠複製的體外模型中，在開始使用 AZD6738 治療 70 小時後，γH2AX 信號持續存在 [1]。停滯的複制叉(Stalled replication forks)可能會破壞 DNA 雙鏈斷裂(DNA double stranded breaks)的形成和共濟失調毛細血管擴張症突變 (ataxia telangiectasia mutated , ATM) 激酶的激活。作為跨癌細胞系的單一藥物，AZD6738 具有活性。在缺乏 ATM 通路的細胞系中，AZD6738 的敏感性(sensitivity)增強 [3]。

在 ATM 缺陷(ATM-deficient)但不精通 ATM 的體內模型中，單獨使用 AZD6738 治療可顯著抑制等效耐受劑量的腫瘤活性。電離輻射 (Ionizing radiation , IR) 是一種 DNA 損傷誘導劑。當AZD6738和IR一起使用時，觀察到消退或抗腫瘤生長抑制活性。在腫瘤組織中，AZD6738 與持續的 γH2AX 染色增加有關。在正常腸道組織(gut tissue)或骨髓(bone marrow)中，用 AZD6738 治療只會暫時增加 γH2AX 染色 [3]。

• 1. Hoang N, Zhang X, et al. "New histone demethylase LSD1 inhibitor selectively targets teratocarcinoma and embryonic carcinoma cells." Bioorg Med Chem. 2018 Feb 7. pii: S0968-0896(17)31942-9. PMID:29439916

APExBIO -DNA Damage/DNA Repair系列產品+236

由於外部（exogenous, 外源性）和內部（endogenous, 內源性）壓力，人體細胞中的 DNA 每天會受到數以萬計的損害(damages)。外源性損害(exogenous damages)是由化學污染(chemical contamination)、紫外線(UV light)、電離輻射(ionizing radiation)和烷基化/甲基化(alkylation/methylation)等引起的，而內源性損害(endogenous damages)是由鹼的氧化(oxidation)、烷基化(alkylation)和水解(hydrolysis)等引起的。由於DNA損傷(double strand breaks)後會發生單鍊(single strand)和雙鏈斷裂(double strand breaks)，未修復的DNA損傷導致細胞衰老(cell senescent)、凋亡(apoptosis)和惡性腫瘤(malignancies)等。為了克服這種威脅，細胞產生了 DNA 損傷反應(DNA damage response)，以檢測 DNA 損傷並介導其修復(repair)。DNA修復涉及錯配、鹼基切除、核苷酸切除修復等多種機制。一組蛋白質和途徑參與了這些過程。 ATM/ATR 激酶和 DNA-PK 對於檢測 DNA 損傷至關重要。染色質重塑劑調節 DNA 修復因子發揮作用的染色質可及性。 RPA、Rad51 和範可尼貧血蛋白直接作用於修復 DNA 損傷。 p53 網絡、RAS GTPase 超家族和泛素系統也在 DNA 損傷反應中發揮重要作用。異常的 DNA 損傷反應與衰老、癌症和免疫疾病有關。

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Chromatin/Epigenetics系列產品+

表觀遺傳學(Epigenetics)是基因表達的可遺傳修飾 (heritable modifications)，與 DNA 序列(DNA sequence)的變化無關。表觀遺傳修飾 (Epigenetic modifications)主要發生在 DNA 或組蛋白八聚體(histone octamer)上。有幾種類型的表觀遺傳學修飾(epigenetics modifications)，DNA-甲基轉移酶 (DNMT) 的 DNA 甲基化和組蛋白的共價修飾，例如乙醯化(acetylation)、甲基化(methylation)、磷酸化(phosphorylation)和泛素化(ubiquitination)。組蛋白乙醯轉移酶 (HAT) 的組蛋白乙醯化參與轉錄激活，而組蛋白去乙醯化酶 (HDAC) 的組蛋白去乙醯化與轉錄抑制(transcriptional repression)有關。組蛋白去甲基化(Histone demethylation)與賴氨酸特異性去甲基化酶 (lysine-specific demethylase , LSD) 和含有組蛋白去甲基化酶 (JHDM) 的 JmjC 結構域(JmjC domain)有關。

核小體(nucleosome)由四種組蛋白（H2A、H2B、H3 和 H4）組成，它們是染色質(chromatin)的主要組成部分。特定化學基團的添加和去除稱為表觀遺傳標記(epigenetic marks)，它調節染色質結構並影響基因表達。此外，RNA 與抑制性染色質狀態(repressive chromatin state)的形成密切相關。

表觀遺傳(Epigenetic)機制在細胞水平上響應環境變化，從而影響細胞可塑性(plasticity)。染色質(Chromatin)和表觀遺傳調控(epigenetic regulation)在發育和應激反應期間的基因組編程中發揮重要作用，表觀遺傳學缺陷(defects in epigenetics)可導致癌症(cancer)、炎症(inflammation)和代謝紊亂(metabolic disorders)等。

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Bromodomain Inhibitor, (+)-JQ1 | CAS# 1268524-70-4  APExBIO  貨號A1910

BET bromodomain inhibitor

Bromodomain Inhibitor, (+)-JQ1 是一種有效且高度特異性的 BET（bromodomain and extra-terminal, 溴結構域和末端外）家族的溴結構域抑制劑。 (+)-JQ1 與 BRD4 溴結構域 1 和 2 結合，Kd 值分別為 ~ 50 和 90 nM。該結合與乙醯賴氨酸(acetyl lysine)競爭。 (+)-JQ1 可以作為一種有用的化學探針來研究 BET 溴結構域在腫瘤發生的轉錄調控中的作用。JQ1 對 BRDT 表現出強烈的劑量和時間依賴性抑制作用，並且可以顯著降低 BRDT 結構近親的活性。仔細觀察 JQ1 結合的 BRDT 證實 BRDT 的乙醯賴氨酸識別位點被阻斷。 [1]JQ1 不產生鎮靜或抗焦慮作用，而是一種有效且選擇性的溴結構域睾丸特異性蛋白 BRDT [2] 抑制劑，該蛋白對精子發生過程中的染色質重塑至關重要。通過阻斷 BRDT，JQ1 有效地阻斷了睾丸中精子的產生，從而產生了有效的避孕效果，而沒有與先前研究的男性激素避孕藥相關的負面副作用。

Product Citation+6

1. Amjad Ali, Jasmin Shafarin, et al. "Co-targeting BET bromodomain BRD4 and RAC1 suppresses growth, stemness and tumorigenesis by disrupting the c-MYC-G9a-FTH1axis and downregulating HDAC1 in molecular subtypes of breast cancer." Int J Biol Sci. 2021 Oct 25;17(15):4474-4492. PMID:34803511

2. Victor Cy Mak, Xinran Li, et al. "p85β alters response to EGFR inhibitor in ovarian cancer through p38 MAPK-mediated regulation of DNA repair." Neoplasia. 2021 Jul;23(7):718-730. PMID:34144267

3. Lars Pache, Matthew D. Marsden, et al. "Pharmacological Activation of Non-canonical NF-κB Signaling Activates Latent HIV-1 Reservoirs In Vivo." Cell Rep Med. 2020 Jun 23;1(3):100037. PMID:33205060

4. Niklas Remke, Savita Bisht, et al. "Selective BET-bromodomain inhibition by JQ1 suppresses dendritic cell maturation and antigen-specific T-cell responses." Cancer Immunol Immunother. 2020 Jul 10. PMID:32651619

5. Xiang Y, Tanaka Y, et al. "Dysregulation of BRD4 Function Underlies the Functional Abnormalities of MeCP2 Mutant Neurons." Mol Cell. 2020;79(1):84-98.e9. PMID:32526163

6. Wu SY, Lee CF, et al. "Opposing Functions of BRD4 Isoforms in Breast Cancer." Mol Cell. 2020;78(6):1114-1132.e10. PMID:32446320

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Chromatin/Epigenetics系列產品+

表觀遺傳學(Epigenetics)是基因表達的可遺傳修飾 (heritable modifications)，與 DNA 序列(DNA sequence)的變化無關。表觀遺傳修飾(Epigenetic modifications)主要發生在 DNA 或組蛋白八聚體(histone octamer)上。有幾種類型的表觀遺傳學修飾(epigenetics modifications)，DNA-甲基轉移酶 (DNMT) 的 DNA 甲基化和組蛋白的共價修飾，例如乙醯化(acetylation)、甲基化(methylation)、磷酸化(phosphorylation)和泛素化(ubiquitination)。組蛋白乙醯轉移酶 (HAT) 的組蛋白乙醯化參與轉錄激活，而組蛋白去乙醯化酶 (HDAC) 的組蛋白去乙醯化與轉錄抑制(transcriptional repression)有關。組蛋白去甲基化(Histone demethylation)與賴氨酸特異性去甲基化酶 (lysine-specific demethylase , LSD) 和含有組蛋白去甲基化酶 (JHDM) 的 JmjC 結構域(JmjC domain)有關。

核小體(nucleosome)由四種組蛋白（H2A、H2B、H3 和 H4）組成，它們是染色質(chromatin)的主要組成部分。特定化學基團的添加和去除稱為表觀遺傳標記(epigenetic marks)，它調節染色質結構並影響基因表達。此外，RNA 與抑制性染色質狀態(repressive chromatin state)的形成密切相關。

表觀遺傳(Epigenetic)機制在細胞水平上響應環境變化，從而影響細胞可塑性(plasticity)。染色質(Chromatin)和表觀遺傳調控(epigenetic regulation)在發育和應激反應期間的基因組編程中發揮重要作用，表觀遺傳學缺陷(defects in epigenetics)可導致癌症(cancer)、炎症(inflammation)和代謝紊亂(metabolic disorders)等。

EPZ-6438 | CAS#1403254-99-8 APExBIO  貨號A8221

EPZ-6438 是一種有效且具有生物活性的 EZH2 抑制劑，EZH2 是多梳抑制複合物 2 (polycomb repressive complex 2 , PRC2) 的催化亞基，可催化組蛋白 H3 (H3K27) 的賴氨酸 27 的甲基化，從而抑制含有人 PRC2 的野生型的活性EZH2 的抑制常數 Ki 值為 2.5 nM。 EPZ-6438 競爭性結合 EZH2 的 S-腺苷甲硫氨酸 (S-adenosylmethionine , SAM) 結合位點，也非競爭性結合肽或核小體底物的結合位點。 EPZ-6438 選擇性抑制 EZH2，選擇性比 EZH1 高 35 倍。研究結果表明，通過 EPZ-6438 介導的 EZH2 抑制對幾種癌症途徑的協同作用，EPZ-6438 在 MRT 模型中表現出顯著且持久的抗腫瘤活性。

http://biopioneer.com.tw/wp-content/uploads/downloads/2022/10/EPZ-6438-CAS1403254-99-8-APExBIO-%E8%B2%A8%E8%99%9FA8221.pdf

Product Citation+6

1. Fumiya Moribe, Momoko Nishikori, et al. "Epigenetic suppression of SLFN11 in germinal center B-cells during B-cell development." PLoS One. 2021 Jan 29;16(1):e0237554. PMID:33513156

2. Otsuka Y, Nishikori M, et al. "EZH2 inhibitors restore epigenetically silenced CD58 expression in B-cell lymphomas." Mol Immunol. 2020;119:35–45. PMID:31962268

3. Anastassiia Vertii, Jianhong Ou, et al. "Two Contrasting Classes of Nucleolus-Associated Domains in Mouse Fibroblast Heterochromatin." bioRxiv. 2018 December 03.

4. Jiang S, Zhou H, et al. "The Epstein-Barr Virus Regulome in Lymphoblastoid Cells." Cell Host Microbe. 2017 Oct 11;22(4):561-573.e4. PMID:29024646

5. Arifuzzaman S, Das A, et al. "Selective inhibition of EZH2 by a small molecule inhibitor regulates microglial gene expression essential for inflammation." Biochem Pharmacol. 2017 Apr 19. pii: S0006-2952(17)30233-2. PMID:28431938

6. Wang H, Tian L, et al. "Bone-in-culture array as a platform to model early-stage bone metastases and discover anti-metastasis therapies." Nat Commun. 2017 Apr 21;8:15045. PMID:28429794

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APExBIO提供優質的胜肽和生物分析試劑，廣泛產品線如Protease、Chromatin/Epigenetics表觀遺傳學、MAPK Signal、DNA Damege/DNA repair、細胞凋亡、腫瘤生物學、Stem cell等研究領域， 還提供定制的服務，包括多肽合成，抗體的生產和檢測的發展。產品線DNA/RNA prep kit、Drug Screening panel、Bioactive peptides、Growth factors、Biotinylation Reagents、tag peptides、amino Acids、Growth factors等。APExBIO產品質量都伴隨著證書的分析，高效液相色譜，質譜，和HMNR數據。

雷帕黴菌（Rapamycin）| Romidepsin (FK228, depsipeptide) | Daptomycin | G-418 (80 S 核醣體延伸抑制劑) 

Chromatin/Epigenetics系列產品+

表觀遺傳學(Epigenetics)是基因表達的可遺傳修飾 (heritable modifications)，與 DNA 序列(DNA sequence)的變化無關。表觀遺傳修飾(Epigenetic modifications)主要發生在 DNA 或組蛋白八聚體(histone octamer)上。有幾種類型的表觀遺傳學修飾(epigenetics modifications)，DNA-甲基轉移酶 (DNMT) 的 DNA 甲基化和組蛋白的共價修飾，例如乙醯化(acetylation)、甲基化(methylation)、磷酸化(phosphorylation)和泛素化(ubiquitination)。組蛋白乙醯轉移酶 (HAT) 的組蛋白乙醯化參與轉錄激活，而組蛋白去乙醯化酶 (HDAC) 的組蛋白去乙醯化與轉錄抑制(transcriptional repression)有關。組蛋白去甲基化(Histone demethylation)與賴氨酸特異性去甲基化酶 (lysine-specific demethylase , LSD) 和含有組蛋白去甲基化酶 (JHDM) 的 JmjC 結構域(JmjC domain)有關。

核小體(nucleosome)由四種組蛋白（H2A、H2B、H3 和 H4）組成，它們是染色質(chromatin)的主要組成部分。特定化學基團的添加和去除稱為表觀遺傳標記(epigenetic marks)，它調節染色質結構並影響基因表達。此外，RNA 與抑制性染色質狀態(repressive chromatin state)的形成密切相關。

表觀遺傳(Epigenetic)機制在細胞水平上響應環境變化，從而影響細胞可塑性(plasticity)。染色質(Chromatin)和表觀遺傳調控(epigenetic regulation)在發育和應激反應期間的基因組編程中發揮重要作用，表觀遺傳學缺陷(defects in epigenetics)可導致癌症(cancer)、炎症(inflammation)和代謝紊亂(metabolic disorders)等。

RGFP966 | CAS#1357389-11-7/1396841-57-8 APExBIO  貨號A8803

Product Citation+1

Specific HDAC3 inhibitor

Chidamide 是一種新型苯甲醯胺型組蛋白脫乙醯酶 (benzamide-type histone deacetylase , HDAC) 抑制劑。人們研究了 CS055 對人白血病細胞系和原發性骨髓性白血病細胞增殖(proliferation)、分化(differentiation)和凋亡(apoptosis)的影響。 組蛋白去乙醯化酶 (Histone deacetylases , HDAC) 是一系列酶，其作用是使組蛋白的氨基末端賴氨酸殘基(amino-terminal lysine residues)乙醯化和去乙醯化，從而導致染色質結構的重塑(remodeling)並影響染色質(chromatin)對轉錄因子的可及性，從而啟動基因轉錄(gene transcription)。 [2 ]西達本胺(Chidamide) 對細胞週期(cell cycle)有影響，它顯著降低了不同 p53 狀態的 BEL-7402 和 HCC-9204 細胞的 S 期細胞分數，同時誘導 G1 期細胞分數顯著增加。隨著劑量的增加，西達本胺(Chidamide)顯著改變了階段分數中的細胞數量。 [2]本研究結果表明，西達本胺(Chidamide)是一種 HDACi，通過抑制細胞增殖(cell proliferation)、誘導人體細胞分化(differentiation)和凋亡(apoptosis)，在多種血液系統惡性腫瘤(haematological malignancies)中具有潛在的治療價值

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APExBIO提供優質的胜肽和生物分析試劑，廣泛產品線如Protease、Chromatin/Epigenetics表觀遺傳學、MAPK Signal、DNA Damege/DNA repair、細胞凋亡、腫瘤生物學、Stem cell等研究領域， 還提供定制的服務，包括多肽合成，抗體的生產和檢測的發展。產品線DNA/RNA prep kit、Drug Screening panel、Bioactive peptides、Growth factors、Biotinylation Reagents、tag peptides、amino Acids、Growth factors等。APExBIO產品質量都伴隨著證書的分析，高效液相色譜，質譜，和HMNR數據。

雷帕黴菌（Rapamycin）| Romidepsin (FK228, depsipeptide) | Daptomycin | G-418 (80 S 核醣體延伸抑制劑) 

Chromatin/Epigenetics系列產品+

表觀遺傳學(Epigenetics)是基因表達的可遺傳修飾 (heritable modifications)，與 DNA 序列(DNA sequence)的變化無關。表觀遺傳修飾(Epigenetic modifications)主要發生在 DNA 或組蛋白八聚體(histone octamer)上。有幾種類型的表觀遺傳學修飾(epigenetics modifications)，DNA-甲基轉移酶 (DNMT) 的 DNA 甲基化和組蛋白的共價修飾，例如乙醯化(acetylation)、甲基化(methylation)、磷酸化(phosphorylation)和泛素化(ubiquitination)。組蛋白乙醯轉移酶 (HAT) 的組蛋白乙醯化參與轉錄激活，而組蛋白去乙醯化酶 (HDAC) 的組蛋白去乙醯化與轉錄抑制(transcriptional repression)有關。組蛋白去甲基化(Histone demethylation)與賴氨酸特異性去甲基化酶 (lysine-specific demethylase , LSD) 和含有組蛋白去甲基化酶 (JHDM) 的 JmjC 結構域(JmjC domain)有關。核小體(nucleosome)由四種組蛋白（H2A、H2B、H3 和 H4）組成，它們是染色質(chromatin)的主要組成部分。特定化學基團的添加和去除稱為表觀遺傳標記(epigenetic marks)，它調節染色質結構並影響基因表達。此外，RNA 與抑制性染色質狀態(repressive chromatin state)的形成密切相關。表觀遺傳(Epigenetic)機制在細胞水平上響應環境變化，從而影響細胞可塑性(plasticity)。染色質(Chromatin)和表觀遺傳調控(epigenetic regulation)在發育和應激反應期間的基因組編程中發揮重要作用，表觀遺傳學缺陷(defects in epigenetics)可導致癌症(cancer)、炎症(inflammation)和代謝紊亂(metabolic disorders)等。

Chidamide | CAS#743420-02-2APExBIO  貨號B5916

Product Citation+1

Novel HDAC inhibitor

Chidamide 是一種新型苯甲醯胺型組蛋白脫乙醯酶 (benzamide-type histone deacetylase , HDAC) 抑制劑。人們研究了 CS055 對人白血病細胞系和原發性骨髓性白血病細胞增殖(proliferation)、分化(differentiation)和凋亡(apoptosis)的影響。組蛋白去乙醯化酶 (Histone deacetylases , HDAC) 是一系列酶，其作用是使組蛋白的氨基末端賴氨酸殘基(amino-terminal lysine residues)乙醯化和去乙醯化，從而導致染色質結構的重塑(remodeling)並影響染色質(chromatin)對轉錄因子的可及性，從而啟動基因轉錄(gene transcription)。 [2 ]西達本胺(Chidamide) 對細胞週期(cell cycle)有影響，它顯著降低了不同 p53 狀態的 BEL-7402 和 HCC-9204 細胞的 S 期細胞分數，同時誘導 G1 期細胞分數顯著增加。隨著劑量的增加，西達本胺(Chidamide)顯著改變了階段分數中的細胞數量。 [2]本研究結果表明，西達本胺(Chidamide)是一種 HDACi，通過抑制細胞增殖(cell proliferation)、誘導人體細胞分化(differentiation)和凋亡(apoptosis)，在多種血液系統惡性腫瘤(haematological malignancies)中具有潛在的治療價值。

1. Zhang M, Urabe G, et al. "HDAC6 Regulates the MRTF-A/SRF Axis and Vascular Smooth Muscle Cell Plasticity." JACC Basic Transl Sci. 2018 Dec 31;3(6):782-795. PMID:30623138

2. Huang L, Lai WH, et al. "Elimination of HIV-1 Latently Infected Cells by Gnidimacrin and a Selective HDAC Inhibitor." ACS Med Chem Lett. 2018 Feb 6;9(3):268-273. PMID:2954137

3. Topper MJ, Vaz M, et al. "Epigenetic Therapy Ties MYC Depletion to Reversing Immune Evasion and Treating Lung Cancer." Cell. 2017 Nov 30;171(6):1284-1300.e21. PMID:29195073

4. Sun XY, Qu Y, et al. "Novel histone deacetylase inhibitor N25 exerts anti-tumor effects and induces autophagy in human glioma cells by inhibiting HDAC3."Oncotarget. 2017 Sep 8;8(43):75232-75242. PMID:29088860

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APExBIO提供優質的胜肽和生物分析試劑，廣泛產品線如Protease、Chromatin/Epigenetics表觀遺傳學、MAPK Signal、DNA Damege/DNA repair、細胞凋亡、腫瘤生物學、Stem cell等研究領域， 還提供定制的服務，包括多肽合成，抗體的生產和檢測的發展。產品線DNA/RNA prep kit、Drug Screening panel、Bioactive peptides、Growth factors、Biotinylation Reagents、tag peptides、amino Acids、Growth factors等。APExBIO產品質量都伴隨著證書的分析，高效液相色譜，質譜，和HMNR數據。

Proteases系列產品-APExBIO

Z-VAD-FMK  、TAPI-1  、Talabostat mesylate、Z-IETD-FMK、Cisplatin、17-DMAG (Alvespimycin) HCl、CA-074 Me 、VX-765

蛋白酶(Proteases)也稱為肽酶(peptidases)或蛋白水解酶(proteolytic enzymes)，由大量催化肽鍵水解(hydrolysis)並隨後導致蛋白質底物(protein substrates)降解為氨基酸(amino acids)的酶組成。蛋白酶(Proteases)與多種人類疾病有關，包括癌症(cancer)、神經退行性疾​​病(neurodegenerative disorders)、炎症性疾病(inflammatory diseases)和心血管疾病(cardiovascular diseases)。因此，許多蛋白酶抑制劑【小分子(small molecules)和蛋白質】已被鑑定為阻斷蛋白酶的活性(proteases)。蛋白酶抑制劑可以根據它們通過兩種一般機制抑制的蛋白酶類別分為不同的類型，即不可逆的“捕獲(trapping)”反應和可逆(reversible)的緊密結合反應。蛋白酶抑制劑已被用作治療蛋白酶相關疾病的診斷劑(diagnostic)或治療劑(therapeutic agents)。APExBIO提供優質的胜肽和生物分析試劑，廣泛產品線如Protease、Chromatin/Epigenetics表觀遺傳學、MAPK Signal、DNA Damege/DNA repair、細胞凋亡、腫瘤生物學、Stem cell等研究領域。Protease系列產品包括Z-VAD-FMK  、TAPI-1  、Talabostat mesylate、Z-IETD-FMK、Cisplatin、17-DMAG (Alvespimycin) HCl、CA-074 Me 、VX-765等240+產品。

Z-VAD-FMK | CAS# 187389-52-2 APExBIO  貨號 A1902

Product Citation+6

Z-VAD-FMK 是一種 ICE 樣蛋白酶抑制劑(ICE-like proteases)，可抑制由多種刺激物誘導的 THP.1 細胞凋亡(apoptosis)和 Fas 抗原誘導的 Jurkat T 細胞凋亡(apoptosis)。它通過阻止 proCPP32 活化為其活性形式來抑制細胞凋亡(apoptosis)，而不是通過直接阻止 CPP32 的蛋白水解作用來抑制細胞凋亡(apoptosis)。Z-VAD-FMK almost completely inhibited the formation of large kilobasepair induced by all four stimuli. Similarly Z-VAD-FMK almost completely inhibited the enhanced formation of large kilobasepair fragments induced by thapsigargin or cycloheximide in the presence of TLCK, in good agreement with its ability to inhibit apoptosis induced by these treatments. These stimuli also induced internucleosomal cleavage of DNA, which was inhibited by Z-VAD-FMK. These results suggested that an ICE-like protease(s) acts at a stage prior to the formation of large kilobasepair fragments of DNA³.

• 1. Jingchun Du, Yougui Xiang, et al. "RIPK1 dephosphorylation and kinase activation by PPP1R3G/PP1γ promote apoptosis and necroptosis." Nat Commun. 2021 Dec 3;12(1):7067. PMID:34862394
• 2. Xinxin Ren, Xiang Wang, et al. "Significance of TEAD Family in Diagnosis, Prognosis and Immune Response for Ovarian Serous Carcinoma." Int J Gen Med. 2021 Oct 27;14:7133-7143. PMID:34737608
• 3. Du Yu, Yundi Zhao, et al. "C19orf66 Inhibits Japanese Encephalitis Virus Replication by Targeting -1 PRF and the NS3 Protein." Virol Sin. 2021 Dec;36(6):1443-1455. PMID:34309824
• 4. Chunhua Shu, Rui Wang, et al. "The "Dextran-Magnetic Layered Double Hydroxide-Fluorouracil" Drug Delivery System Exerts Its Anti-tumor Effect by Inducing Lysosomal Membrane Permeability in the Process of Cell Death." Biol Pharm Bull. 2021 Oct 1;44(10):1473-1483. PMID:34305072
• 5. Qionghui Zhan, Jaepyo Jeon, et al. "CAMK2/CaMKII activates MLKL in short-term starvation to facilitate autophagic flux." Autophagy. 2022 Apr;18(4):726-744. PMID:34282994
• 6. Jia-yuan Zhang, Bo Zhou, et al. "The metabolite α-KG induces GSDMC-dependent pyroptosis through death receptor 6-activated caspase-8." Cell Res. 2021 Sep;31(9):980-997. PMID:34012073

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APExBIO提供優質的胜肽和生物分析試劑，廣泛產品線如Protease、Chromatin/Epigenetics表觀遺傳學、MAPK Signal、DNA Damege/DNA repair、細胞凋亡、腫瘤生物學、Stem cell等研究領域， 還提供定制的服務，包括多肽合成，抗體的生產和檢測的發展。產品線DNA/RNA prep kit、Drug Screening panel、Bioactive peptides、Growth factors、Biotinylation Reagents、tag peptides、amino Acids、Growth factors等。APExBIO產品質量都伴隨著證書的分析，高效液相色譜，質譜，和HMNR數據。

雷帕黴菌（Rapamycin）| Romidepsin (FK228, depsipeptide) | Daptomycin | G-418 (80 S 核醣體延伸抑制劑)

APExBIO - PD-1/PD-L1 inhibitor系列產品

Nivolumab | CAS#946414-94-4 APExBIO貨號B8222

PD-1/PD-L1 inhibitor

Nivolumab，也稱為 Opdivo，是一種單克隆抗體(monoclonal antibody)，用於通過抑制稱為程序性死亡-1 (PD-1) 的細胞途徑來治療晚期非小細胞肺癌 (non-small cell lung cancer , NSCLC)。Nivolumab與T細胞表面的PD-1結合，從而阻斷PD-1/PD-2觸發的免疫抑制信號通路，恢復T細胞(antitumor function)的抗腫瘤功能。Nivolumab以高特異性結合 PD-1 [1]，納武單抗可有效抑制 PD-1 與其配體（PD-L1 和 PD-L2，IC50 值分別為 2.52 和 2.59 nmol/L）的相互作用。在 CHO 細胞中，使用 FACS 評估配體與 PD-1 的結合，Nivolumab單抗介導的 PD-1 與 PD-L1 結合的抑制（IC50 值為 1.04 nmol/L）和 PD-L2（IC50 值）之間沒有明顯差異0.97 nmol/L)。此外，當缺乏抗原或 T 細胞受體刺激時，nivolumab沒有刺激作用，不會引起非特異性淋巴細胞活化(nonspecific lymphocyte activation) [2]。在cynomolgus monkey模型中使用 10 和 50 mg/kg Nivolumab (i.v.)，血清 nivolumab 似乎沒有明顯變化，也沒有明顯的性別差異。用 50 mg/kg nivolumab治療後，T4 和 TSH 水平沒有變化，但 T3 在女性中可逆地下降了 28%，而在男性中，T3、T4 或 TSH 水平沒有變化 [2]。nivolumab在猴子身上可能沒有毒性，但在人體臨床試驗中已經觀察到這種毒性，nivolumab在 I 期試驗中具有良好的安全性 [1]。一個值得研究的問題是，在 PD-1 缺陷小鼠中觀察到的肺炎是 MRL 遺傳背景而不是其他遺傳背景引起的 [2]。

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雷帕黴菌（Rapamycin）| Romidepsin (FK228, depsipeptide) | Daptomycin | G-418 (80 S 核醣體延伸抑制劑)

RHPS4n | CAS#390362-78-4 APExBIO貨號B6186

Telomerase inhibitor

IC50：M14 細胞在 5 天生長抑制試驗(growth inhibition assay)中約為 3 μM.

RHPS4 是一種端粒酶抑制劑(telomerase inhibitor)。染色體末端(chromosome termini)的保護、降解(degradation)和重組(recombination)受端粒(telomeres)調控。最近的一個模型提出端粒(telomeres)可以在染色體末端(chromosome end)形成一個cap。因此，端粒帽的完整性(telomere cap integrity)應該是完整的，以允許細胞分裂(cell division)繼續進行。體外試驗：發現 RHPS4 對 UXF1138L 細胞的處理導致端粒酶催化亞基 (telomerase catalytic subunit, hTERT) 從細胞核中置換出來，誘導端粒啟動的 DNA 損傷信號傳導(f telomere-initiated DNA-damage signaling)以及染色體融合(chromosome fusions)。進一步報導了 RHPS4 對以集落形式(colonies)生長的癌細胞比以單層形式(monolayers)生長的細胞更有效。此外，人臍帶血(human cord blood)和HEK293T胚胎腎細胞(HEK293T embryonic kidney cell)集落的形成單位對RHPS4的抵抗力更強[1]。體內試驗：動物研究發現，與對照組相比，經 RHPS4 處理的 UXF1138L 異種移植物的克隆形成性降低、核 hTERT 表達缺失和有絲分裂異常的誘導。儘管單獨的 RHPS4 顯示出有限的體內功效，但與有絲分裂紡錘體毒物紫杉醇的聯合治療可導致腫瘤緩解並進一步增強端粒功能障礙 [1]。

1. Chen H, Sun H, et al. "Monitoring autophagy in live cells with a fluorescent light-up probe for G-quadruplex structures." Chem Commun (Camb). 2019 Apr 25;55(35):5060-5063. PMID:30907894

2. SugeZhang, HongxiaSun, et al. "Evaluation of the selectivity of G-quadruplex ligands in living cells with a small molecule fluorescent probe." Analytica Chimica Acta: X. Available online 23 April 2019, 100017.

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雷帕黴菌（Rapamycin）| Romidepsin (FK228, depsipeptide) | Daptomycin | G-418 (80 S 核醣體延伸抑制劑) 

細胞反應(Cellular responses)由與特定受體結合的蛋白質(proteins)、藥物(drugs)或病原體(pathogens)觸發。受體介導(Receptor mediated signaling)的信號傳導是放大信號的酶促反應級聯。調節受體功能的激動劑(agonists)和拮抗劑(antagonists)是研究和醫療實踐的重要工具。

SCR7 | CAS#1533426-72-0 APExBIO  貨號A8705

DNA ligase IV inhibitor

Scr7 是一種 DNA 連接酶 IV 抑制劑(DNA ligase IV inhibitor)，最初被確定為一種抗癌劑 (anti-cancer agent)。Scr7 靶向 DNA 連接酶 IV 的 DNA 結合域(DNA binding domain)，降低其對雙鏈斷裂 (double strand breaks , DSB) 的親和力並抑制其功能。 Scr7 還抑制 DNA 連接酶 III（但不抑制 DNA 連接酶 I），儘管效率較低。用強力黴素處理細胞以誘導 Cas9 表達，用不同濃度的 Scr7 處理 24 小時。 Scr7 維持的細胞能夠進入 S/G2 期，這是 HDR 所必需的 [1]。用 Scr7 治療小鼠會影響淋巴細胞發育，因為 DNA 連接酶 IV(DNA ligase IV) 在通過 C-NHEJ16 進行 V(D)J 重組過程中編碼末端的連接中起關鍵作用。由於 Scr7 的非共價結合模式，Scr7 治療後淋巴細胞發育的缺陷是短暫的和可逆的。 Scr7 通過瞬時阻斷 NHEJ（依賴 DNA 連接酶 I 的 alt-NHEJ 除外）增強 HDR 的頻率，從而在培養細胞和小鼠中通過 CRISPR-Cas9 進行精確的基因組編輯(genome editing) [2]。